余慈站钢结构包括线下站房、站台雨棚两部分。站台层高16.55米，站台2座，尺寸均为450X12米，为高架车站。雨棚梁顶标高17.85米。线下站房为混凝土框架结构，局部轻钢屋面，站房由钢梁、钢支撑组成，钢梁最大跨度为32.7米，地上一层，局部设夹层。站台雨棚为铁路桥梁帽梁支承的钢管柱及实腹钢梁组成的钢框架结构体系，轻钢屋面，主要由钢梁、钢柱、门拱桁架、钢支撑、钢屋架、连接件等组成，钢柱最高为27.85米。